Das Frankentaler Rote Kreuz hat die Organisationsform eines Vereins. Oberstes Organ ist die Rotkreuzversammlung. Als geschäftsführendes Organ fungiert der Rotkreuzrat, an der Spitze steht die:der Präsident:in des Frankentaler Roten Kreuzes. Innerhalb des FRK haben sich fünf Ortsvereine gebildet, die eine oder mehrere politische Gemeinden umfassen.

Dem FRK sind die Rettungsorganisationen Frankentaler Samariterbund und Frankentaler Lebens-Rettungsgesellschaft angegliedert.